Совершенствование методов приготовления ДНК-библиотек

Совершенствование методов приготовления ДНК-библиотек

После секвенирования проводится «сборка» последовательности исходного участка ДНК из полученных перекрывающихся фрагментов. При помощи такой стратегии были полностью расшифрованы первые крупные эукариотические геномы — дрозофилы и человека. Первичная расшифровка генома человека стоила 3 млрд долл. и заняла около 13 лет работы десятков институтов во многих странах. Наивысшего развития метод дробовика достиг после разработки компанией Applied Biosystems первых автоматических секвенаторов ДНК. Наивысшего развития метод дробовика достиг после разработки компанией Applied Biosystems первых автоматических секвенаторов ДНК. В них используется метод терминации цепи (так называемый ди- дезокси-метод) [Smith etak, 1986], а электрофорез и разделение фрагментов ДНК разной длины проводится не в пластине полиакриламидного геля, а в специальном полимере, заполняющем капилляры.

В каждом капилляре анализируется набор фрагментов, полученный в результате удлинения затравки на матрице (точнее, на множестве копий) одноцепочечной молекулы ДНК. Совершенствование методов приготовления ДНК-библиотек и биоинформатических подходов к сборке геномов также привело к значительному ускорению и удешевлению секвенирования. Так, система усовершенствований, предложенная компанией Celera Genomics, позволила расшифровать и собрать геном человека за три года «всего» за 300 млн долл.

Оставить комментарий

Почта (не публикуется) Обязательные поля помечены *

Вы можете использовать эти HTML теги и атрибуты: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <strike> <strong>

Подтвердите, что Вы не бот — выберите самый большой кружок: